針對教牧在牧養職場信徒的挑戰，HKPES設計了不同系列的培訓課程及工坊，裝備教牧回應在職信徒的需要。近年因應堂會管治的議題，HKPES更 與香港浸會大學工商管理學院企業發展研究所（簡稱 IED）合辦培訓課程，好讓教牧同工在其牧養的職場上更有效地發揮其職事及角色。過去曾合辦的課程如：《衝突管理證書課程》、《程式公義的法理情 》研討會、 「香港基督教教牧同工身心靈健康及工作狀況」發表會、「釋放教會的潛能：領導與管理」研討會、「開拓籌款的藍海 – 基督教機構如何籌募經費」研討會和工作坊等。